Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShdO88834 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ShdO88834 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShdO88834 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShdO88834 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ShdO88834 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShdO88834 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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