Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms