Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dsg2O55111 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dsg2O55111 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Dsg2O55111 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg2O55111 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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