Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ptpn20O55082 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptpn20O55082 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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