Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3O55013 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms