Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfibp2O35711 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms