Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcc1O35379 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms