Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Kcns1O35173 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Kcns1O35173 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Kcns1O35173 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Kcns1O35173 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Kcns1O35173 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Kcns1O35173 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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