Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Casq1O09165 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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