Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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PbsnO08976 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PbsnO08976 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PbsnO08976 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PbsnO08976 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PbsnO08976 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PbsnO08976 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms