Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Cldn34c3J3QJW5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn34c3J3QJW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn34c3J3QJW5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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