Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms