Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp72F8VQC1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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