Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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