Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Defa35E9QLQ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Defa35E9QLQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Defa35E9QLQ1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms