Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms