Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3095E9Q058 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms