Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms