Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp3Q9QY23 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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