Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700016D06RikQ9DAA5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms