Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms