Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms