Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd1Q9CQX5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd1Q9CQX5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms