Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec3Q99J72 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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