Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sf3b5Q923D4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sf3b5Q923D4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sf3b5Q923D4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sf3b5Q923D4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms