Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf6Q91YR7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf6Q91YR7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms