Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Col26a1Q91VF6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Col26a1Q91VF6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col26a1Q91VF6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col26a1Q91VF6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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