Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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