Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms