Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms