Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calcoco1Q8CGU1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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