Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pggt1bQ8BUY9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pggt1bQ8BUY9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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