Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco3Q8BH01 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco3Q8BH01 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms