Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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