Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms