Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP54Q7Z3B4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms