Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Sys1Q78S06 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sys1Q78S06 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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