Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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