Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx13Q6PHS6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx13Q6PHS6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms