Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fhod1Q6P9Q4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fhod1Q6P9Q4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms