Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms