Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgb4Q6P8W9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms