Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3cQ62181 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms