Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhocQ62159 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhocQ62159 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhocQ62159 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RhocQ62159 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms