Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Afap1l2Q5DTU0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms