Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2f8Q58FA4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms