Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt35Q497I4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms