Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll12Q3UDE2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttll12Q3UDE2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms