Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms