Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms